НПО «Рубикон-Инновация» сотрудничает с ведущими научно-техническими центрами, предприятиями Министерства промышленности и торговли, предприятиями Федерального космического агентства, среди них:

• ОАО «Ракетно-космическая корпорация «Энергия» им. С.П. Королёва»
  Россия, Московская обл., г.Королев, ул.Ленина, д.4А

• Открытое акционерное общество «Научно-исследовательский институт авиационного оборудования»
  (ОАО НИИАО)
  Россия, Московская обл., г.Жуковский, ул.Туполева, д.18

• Федеральное государственное унитарное предприятие «Научно-производственный центр «Вигстар»
  (ФГУП НПЦ «Вигстар»)
  Россия, г.Москва, 1-й Дорожный проезд, д.8

• Федеральное государственное унитарное предприятие «Научно-исследовательский институт Аргон»
  (ФГУПНИИ «Аргон»)
  Россия, г.Москва, Варшавское шоссе, д.125

• Открытое акционерное общество «Российская корпорация ракетно-космического приборостроения и информационных систем»
  (ОАО «Российские космические системы»)
  Россия, г.Москва, ул.Авиамоторная, д.53

• ЗАО «НТЦ Модуль»
  Россия, г.Москва, 4-я улица 8-го марта, д.3

• ЗАО «Русская промышленная компания»
  Россия, г.Москва, Петроверигский переулок, д.4

• ОАО «Пеленг»
  Республика Беларусь, г.Минск, ул.Макаенка, д.23

• ОАО «Информационные спутниковые системы» им. академика М.Ф. Решетнёва»
  Россия, Краснодарский край, г.Железногорск, ул.Ленина, д.52